相对定量蛋白质组学（SWATH）
SWATH采集模式能够将扫描区间内所有的肽段母离子经过超高速扫描并进行二级碎裂，从而获得完整的肽段信息。美吉生物在该技术方面有丰富的经验。
SILAC定量蛋白质组
2002年，丹麦Mann实验室的OngSE等对AACT技术作了进一步改进，建立了SILAC技术并首次应用于定量蛋白质组研究，为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案。
大肠杆菌的蛋白表达和纯化
义翘神州开发出多种宿主系统，能在大肠杆菌中表达蛋白。通常采用可溶性表达以及包涵体表达系统来表达各种不能糖基化的蛋白质，可以制备克到千克级的可溶性蛋白。
iTRAQ定量蛋白质组
基于对肽段的NH2-进行标记，将来自不同样品的同一个肽段做上不同的标记，通过标记物质的含量来指示肽段的含量，并根据肽段含量推断出对应蛋白质的含量。
目标蛋白质组（MRMHR）
MRM（Multiple reaction monitoring）作为一种质谱检测的分析方法，具有特异性强、灵敏度高、准确度高、重现性好、线性动态范围宽、自动化高通量的突出优点，在基于蛋白质组学的生物